Facebook
Moleküler biyoloji ve DNA dizileme teknolojilerindeki gelişmelerle birlikte biyolojik problemler genom çapında cevaplanmaya başlamıştır. Yeni-nesil dizileme teknolojisinden bu yana, DNA dizileme maliyetleri düşmüş, böylece moleküler deneyler form değiştirmeye başlamıştır. DNA ile ilişkili problemleri genom skalasında cevaplamak üzere deneyler geliştirilebilmektedir. Sonuç olarak, yeni-nesil dizileme tabanlı teknolojilerin sayısı her yıl artmaktadır. Büyük ölçeklerde birikmekte olan veri kümeleri, orijinal soruyla ilgili ancak ayrı soruları cevaplamak üzere faklı bakış açılarıyla yeniden analiz edilmektedir. Bu sebepten, bu tekniklerin nasıl çalıştığı ve uygulandığının yanısıra bilgisayar ortamında nasıl analiz edildiğini öğrenmek çok önemlidir. Bu ders, RNA-seq, GRO-seq, NET-seq, ChIP- seq, DNase-seq, FAIRE-seq, Hi-C-seq, XR-seq, Damage- seq gibi mevcut dizileme tekniklerinin bir kısmını kapsaycaktır. Öğrenciler bu tekniklerin teorik olarak nasıl uygulanacağını ve pratik olarak nasıl analiz edileceğini öğreneceklerdir. Öğrencilere, ilgili makaleleri okuma ve sunma ödevleri verilecektir. Öğrenciler dönem boyunca dizileme analizi gerektiren bir proje geliştirip, dönem tamamlayacaklardır.
SU Kredi : 3
AKTS Kredi : 10
Ön Koşul : -
Yan Koşul : -